Zgadzam się Nasza strona zapisuje niewielkie pliki tekstowe, nazywane ciasteczkami (ang. cookies) na Twoim urządzeniu w celu lepszego dostosowania treści oraz dla celów statystycznych. Możesz wyłączyć możliwość ich zapisu, zmieniając ustawienia Twojej przeglądarki. Korzystanie z naszej strony bez zmiany ustawień oznacza zgodę na przechowywanie cookies w Twoim urządzeniu.
Pakiet do obliczeń kwantowo-chemicznych, umożliwiający badanie struktury elektronowej układów molekularnych za pomocą rozmaitych metod ab initio.
Status: Aplikacja dostępna częściowo – nie wszystkie wersje działają poprawnie. Działające wersje 8/12. Działające klastry 3/3. Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.
Nazwa modułu: plgrid/apps/molpro
Stan aplikacji: Dostępna
Testowana: Częściowo
Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014
Dziedziny: Chemia, Chemia kwantowa
Licencja: Płatna licencja do zastosowań niekomercyjnych
Producent: Uniwersytet Cardiff
Adres strony: http://www.molpro.net/
Opiekun: Tak
Status: Aplikacja dostępna produkcyjnie i działająca poprawnie. Działające instancje 1/1. Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.
Nazwa modułu: plgrid/apps/molpro/2015.1.11
Stan wersji: Dostępna
Testowana: Tak
Data wprowadzenia do oferty: 19 września 2016
MOLPRO jest pakietem kwantowo-chemicznych, oferującym możliwość prowadzenia obliczeń z wykorzystaniem szerokiego zakresu metod teoretycznych, ze szczególnym uwzględnieniem metod korelacyjnych ab initio.
Główne cechy MOLPRO:
Pakiet napisany jest głównie w języku Fortran90. Licencjonowaniem MOLPRO zajmuje się University College Cardiff Consultants Limited.
#!/bin/env bash
##### Amount of nodes requested by job
#SBATCH --nodes=1
##### Amount of tasks per node
#SBATCH --ntasks-per-node=1
##### Amount of CPUS per MPI task
#SBATCH --cpus-per-task=4
##### Wall time requested by job
#SBATCH --time=5
##### User mail for notification
#SBATCH --mail-type=END,FAIL,TIME_LIMIT_80
#SBATCH --mail-user=<user's mail>
##### Max amount of RAM requested by job per node
#SBATCH --mem=10gb
##### Partition name #SBATCH -p plgrid
##### Name of job in queuing system
#SBATCH -J nazwa_zadania
##### Name of computational grant used
#SBATCH -A <user's computational grant>
# Set environment for Molpro version 2015.1.11
module add plgrid/apps/molpro/2015.1.11
# Commands to start computations
molpro -d $SCRATCHDIR -W $SLURM_SUBMIT_DIR/wfu --single-helper-server input.inp
Skrypt ten na podstawie ustawień parametrów "--ntasks-per-node=" oraz --cpus-per-task= ustawiamy odpowiednio ilośc procesów MPI na węźle (każdy z nich może użyć całość pamięci RAM deklarowanej w pliku wejściowym Molpro - input.inp - parametrem "memory,xx") oraz ilość wątków OpenMP per proces MPI.
Zalecane ustawienia: