Informacja o cookies
Zgadzam się Nasza strona zapisuje niewielkie pliki tekstowe, nazywane ciasteczkami (ang. cookies) na Twoim urządzeniu w celu lepszego dostosowania treści oraz dla celów statystycznych. Możesz wyłączyć możliwość ich zapisu, zmieniając ustawienia Twojej przeglądarki. Korzystanie z naszej strony bez zmiany ustawień oznacza zgodę na przechowywanie cookies w Twoim urządzeniu.
bowtie2
Ultrafast and memory-efficient tool for aligning sequencing reads to long reference sequences.
Status: Aplikacja dostępna w ofercie, bez kontroli poprawności działania – nietestowana. Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.
Nazwa modułu: plgrid/apps/bowtie2
Stan aplikacji: Dostępna
Testowana: Nie
Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014
Opiekun: Tak
2.1.0
Status: Aplikacja dostępna w ofercie, bez kontroli poprawności działania – nietestowana. Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.
Nazwa modułu: plgrid/apps/bowtie2/2.1.0
Stan wersji: Dostępna
Testowana: Nie
Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.
Zaloguj się
It is particularly good at aligning reads of about 50 up to 100s or 1,000s of characters, and particularly good at aligning to relatively long (e.g. mammalian) genomes. Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index to keep its memory footprint small: for the human genome, its memory footprint is typically around 3.2 GB. Bowtie 2 supports gapped, local, and paired-end alignment modes.
Status monitoringu
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.
Zaloguj się
Moduły domyślne w ścieżkach
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.
Zaloguj się