Informacja o cookies

Zgadzam się Nasza strona zapisuje niewielkie pliki tekstowe, nazywane ciasteczkami (ang. cookies) na Twoim urządzeniu w celu lepszego dostosowania treści oraz dla celów statystycznych. Możesz wyłączyć możliwość ich zapisu, zmieniając ustawienia Twojej przeglądarki. Korzystanie z naszej strony bez zmiany ustawień oznacza zgodę na przechowywanie cookies w Twoim urządzeniu.

bowtie2

Ultrafast and memory-efficient tool for aligning sequencing reads to long reference sequences.

Status:   Aplikacja dostępna w ofercie, bez kontroli poprawności działania – nietestowana.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/bowtie2

Stan aplikacji: Dostępna

Testowana: Nie

Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014

Opiekun: Tak

  • ← poprzednia
  • strona 1 z 1
  • następna →
9 elementów
Wersja Szczegóły Status
2.1.0 Moduł: plgrid/apps/bowtie2/2.1.0
Stan: Nietestowana Data wydania: 1 grudnia 2014 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2.2.1 Moduł: plgrid/apps/bowtie2/2.2.1
Stan: Nietestowana Data wydania: 1 grudnia 2014 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2.2.3 Moduł: plgrid/apps/bowtie2/2.2.3
Stan: Nietestowana Data wydania: 1 grudnia 2014 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2.2.4 Moduł: plgrid/apps/bowtie2/2.2.4
Stan: Nietestowana Data wydania: 22 stycznia 2015 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2.2.9 Moduł: plgrid/apps/bowtie2/2.2.9
Stan: Nietestowana Data wydania: 4 sierpnia 2016 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2.3.0 Moduł: plgrid/apps/bowtie2/2.3.0
Stan: Nietestowana Data wydania: 30 stycznia 2017 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2.3.4 Moduł: plgrid/apps/bowtie2/2.3.4
Stan: Nietestowana Data wydania: 17 lutego 2018 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2.3.5.1 Moduł: plgrid/apps/bowtie2/2.3.5.1
Stan: Nietestowana Data wydania: 16 września 2019 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2.4.0 Moduł: plgrid/apps/bowtie2/2.4.0
Stan: Nietestowana Data wydania: 29 lutego 2020 Testowana: Nie Opiekun: Tak
  • ← poprzednia
 
 z 1
  • następna →

bowtie2

It is particularly good at aligning reads of about 50 up to 100s or 1,000s of characters, and particularly good at aligning to relatively long (e.g. mammalian) genomes. Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index to keep its memory footprint small: for the human genome, its memory footprint is typically around 3.2 GB. Bowtie 2 supports gapped, local, and paired-end alignment modes.

Status monitoringu

Aby zobaczyć wyniki monitorowania aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Moduły domyślne w ścieżkach

Aby zobaczyć listę domyślnych modułów aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Przypadki użycia

Brak przypadków użycia

Ostatnie wiadomości