Zgadzam się Nasza strona zapisuje niewielkie pliki tekstowe, nazywane ciasteczkami (ang. cookies) na Twoim urządzeniu w celu lepszego dostosowania treści oraz dla celów statystycznych. Możesz wyłączyć możliwość ich zapisu, zmieniając ustawienia Twojej przeglądarki. Korzystanie z naszej strony bez zmiany ustawień oznacza zgodę na przechowywanie cookies w Twoim urządzeniu.
ADF (Amsterdam Density Functional) to program umożliwiający obliczenia kwantowochemiczne układów molekularnych z zastosowaniem teorii funkcjonałów gęstości (DFT). Jedną z jego unikalnych właściwości jest wykorzystywanie do obliczeń baz funkcyjnych opartych na funkcje typu Slatera (STO) zamiast powszechnie stosowanych baz zbudowanych z funkcji gaussowskich (GTO). Dodatkową zaletą pakietu są rozbudowane narzędzia graficzne umożliwiające zaawansowaną analizę wyników.
Status: Aplikacja dostępna częściowo – nie wszystkie wersje działają poprawnie. Działające wersje 16/23. Działające klastry 3/3. Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.
Nazwa modułu: plgrid/apps/adf
Stan aplikacji: Dostępna
Testowana: Częściowo
Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014
Dziedziny: Chemia, Chemia kwantowa
Tagi: Density Functional Theory, Modelowanie molekularne, STO, Teoria Funkcjonałów Gęstości
Licencja: Licencja własna ADF szczegóły »
Pełny opis licencji znajduje się na stronie http://www.scm.com/Sales/LicTerms.html
Producent: Scientific Computing & Modelling (SCM) NV
Adres strony: http://www.scm.com/Products/ADF.html
Opiekun: Tak
Wersja | Szczegóły | Status |
---|---|---|
2010.02 | Moduł: plgrid/apps/adf/2010.02 | |
2012.01 | Moduł: plgrid/apps/adf/2012.01 | |
2012.01c | Moduł: plgrid/apps/adf/2012.01c | |
2013.01 | Moduł: plgrid/apps/adf/2013.01 | |
2014.01 | Moduł: plgrid/apps/adf/2014.01 | |
2014.05 | Moduł: plgrid/apps/adf/2014.05 | |
2014.07 | Moduł: plgrid/apps/adf/2014.07 | |
2014.10 | Moduł: plgrid/apps/adf/2014.10 | |
2016.101 | Moduł: plgrid/apps/adf/2016.101 | |
2016.102 | Moduł: plgrid/apps/adf/2016.102 | |
2016.107 | Moduł: plgrid/apps/adf/2016.107 | |
2016.108 | Moduł: plgrid/apps/adf/2016.108 | |
2017.101 | Moduł: plgrid/apps/adf/2017.101 | |
2017.103 | Moduł: plgrid/apps/adf/2017.103 | |
2017.105 | Moduł: plgrid/apps/adf/2017.105 | |
2017.106 | Moduł: plgrid/apps/adf/2017.106 | |
2017.110.r61742.0.718 | Moduł: plgrid/apps/adf/2017.110.r61742.0.718 | |
2017.114 | Moduł: plgrid/apps/adf/2017.114 | |
2018.104 | Moduł: plgrid/apps/adf/2018.104 | |
2019.301 | Moduł: plgrid/apps/adf/2019.301 | |
2019.304 | Moduł: plgrid/apps/adf/2019.304 | |
2020.101 | Moduł: plgrid/apps/adf/2020.101 | |
2020.103 | Moduł: plgrid/apps/adf/2020.103 |
#!/bin/env bash
##### Amount of nodes requested by job
#SBATCH --nodes=1
##### Amount of tasks per node
#SBATCH --tasks-per-node=24
##### Wall time requested by job
#SBATCH --time=15:00
##### Max amount of RAM requested by job per cpu
#SBATCH --mem-per-cpu=4gb
##### Partition name
#SBATCH -p plgrid-testing
##### Name of job in queuing system
#SBATCH --job-name=adf.parallel
##### Name of computational grant used
#SBATCH -A <computational grant name>
echo "Computation started on work node: "; hostname
# Set environment for default ADF version
module add plgrid/apps/adf
# Information about temporary scratch directory
echo "Temporary files stored in" $SCM_TMPDIR
# Commands to start computations
adf < input.in >& input.log
# Remove the scratch dir
rm -f $SCM_TMPDIR
#!/bin/env bash
##### Max amount of RAM requested by job
#PBS -l mem=12gb
##### Amount of nodes=x:cores=y requested by job
#PBS -l nodes=1:ppn=12
##### Wall time requested by job
#PBS -l walltime=15:00
##### Queue name
#PBS -q plgrid-testing
##### Name of job in queuing system
#PBS -N adf.parallel
##### Name of computational grant used
#PBS -A <computational grant name>
echo "Computation started on work node: "; hostname
# Set environment for default ADF version
module add plgrid/apps/adf
# Changing directory to one from which PBS script was stated (where inputs should be stored)
cd $PBS_O_WORKDIR
# Information about temporary scratch directory
echo "Temporary files stored in" $SCM_TMPDIR
# Commands to start computations
adf < input.in >& input.log
# Remove the scratch dir
rm -f $SCM_TMPDIR