Informacja o cookies

Zgadzam się Nasza strona zapisuje niewielkie pliki tekstowe, nazywane ciasteczkami (ang. cookies) na Twoim urządzeniu w celu lepszego dostosowania treści oraz dla celów statystycznych. Możesz wyłączyć możliwość ich zapisu, zmieniając ustawienia Twojej przeglądarki. Korzystanie z naszej strony bez zmiany ustawień oznacza zgodę na przechowywanie cookies w Twoim urządzeniu.

ADF

ADF (Amsterdam Density Functional) to program umożliwiający obliczenia kwantowochemiczne układów molekularnych z zastosowaniem teorii funkcjonałów gęstości (DFT). Jedną z jego unikalnych właściwości jest wykorzystywanie do obliczeń baz funkcyjnych opartych na funkcje typu Slatera (STO) zamiast powszechnie stosowanych baz zbudowanych z funkcji gaussowskich (GTO). Dodatkową zaletą pakietu są rozbudowane narzędzia graficzne umożliwiające zaawansowaną analizę wyników.


Status:   Aplikacja dostępna częściowo – nie wszystkie wersje działają poprawnie. Działające wersje 16/23. Działające klastry 3/3.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/adf

Stan aplikacji: Dostępna

Testowana: Częściowo

Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014

Dziedziny: Chemia, Chemia kwantowa

Tagi: Density Functional Theory, Modelowanie molekularne, STO, Teoria Funkcjonałów Gęstości

Licencja: Licencja własna ADF szczegóły »

Pełny opis licencji znajduje się na stronie http://www.scm.com/Sales/LicTerms.html

Producent: Scientific Computing & Modelling (SCM) NV

Adres strony: http://www.scm.com/Products/ADF.html

Opiekun: Tak


  • ← poprzednia
  • strona 1 z 1
  • następna →
23 elementy
Wersja Szczegóły Status
2010.02 Moduł: plgrid/apps/adf/2010.02
Stan: Dostępna Data wydania: 1 grudnia 2014 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2012.01 Moduł: plgrid/apps/adf/2012.01
Stan: Niedostępna Data wydania: 1 grudnia 2014 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2012.01c Moduł: plgrid/apps/adf/2012.01c
Stan: Dostępna Data wydania: 1 grudnia 2014 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2013.01 Moduł: plgrid/apps/adf/2013.01
Stan: Dostępna Data wydania: 1 grudnia 2014 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2014.01 Moduł: plgrid/apps/adf/2014.01
Stan: Problemy Data wydania: 1 grudnia 2014 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2014.05 Moduł: plgrid/apps/adf/2014.05
Stan: Niedostępna Data wydania: 27 lutego 2015 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2014.07 Moduł: plgrid/apps/adf/2014.07
Stan: Dostępna Data wydania: 4 sierpnia 2016 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2014.10 Moduł: plgrid/apps/adf/2014.10
Stan: Dostępna Data wydania: 4 sierpnia 2016 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2016.101 Moduł: plgrid/apps/adf/2016.101
Stan: Dostępna Data wydania: 30 marca 2016 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2016.102 Moduł: plgrid/apps/adf/2016.102
Stan: Dostępna Data wydania: 4 sierpnia 2016 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2016.107 Moduł: plgrid/apps/adf/2016.107
Stan: Dostępna Data wydania: 6 lutego 2017 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2016.108 Moduł: plgrid/apps/adf/2016.108
Stan: Dostępna Data wydania: 23 grudnia 2017 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2017.101 Moduł: plgrid/apps/adf/2017.101
Stan: Dostępna Data wydania: 13 kwietnia 2017 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2017.103 Moduł: plgrid/apps/adf/2017.103
Stan: Dostępna Data wydania: 22 kwietnia 2017 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2017.105 Moduł: plgrid/apps/adf/2017.105
Stan: Dostępna Data wydania: 23 grudnia 2017 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2017.106 Moduł: plgrid/apps/adf/2017.106
Stan: Dostępna Data wydania: 22 lipca 2017 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2017.110.r61742.0.718 Moduł: plgrid/apps/adf/2017.110.r61742.0.718
Stan: Dostępna Data wydania: 23 grudnia 2017 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2017.114 Moduł: plgrid/apps/adf/2017.114
Stan: Nietestowana Data wydania: 21 marca 2020 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2018.104 Moduł: plgrid/apps/adf/2018.104
Stan: Dostępna Data wydania: 7 grudnia 2018 Testowana: Tak Opiekun: Tak
2019.301 Moduł: plgrid/apps/adf/2019.301
Stan: Nietestowana Data wydania: 29 listopada 2019 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2019.304 Moduł: plgrid/apps/adf/2019.304
Stan: Nietestowana Data wydania: 1 czerwca 2020 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2020.101 Moduł: plgrid/apps/adf/2020.101
Stan: Nietestowana Data wydania: 12 marca 2021 Testowana: Nie Opiekun: Tak
2020.103 Moduł: plgrid/apps/adf/2020.103
Stan: Niedostępna Data wydania: 19 kwietnia 2021 Testowana: Tak Opiekun: Tak
  • ← poprzednia
 
 z 1
  • następna →

ADF

Skrypty obliczeniowe

SLURM

#!/bin/env bash
##### Amount of nodes requested by job
#SBATCH --nodes=1
##### Amount of tasks per node
#SBATCH --tasks-per-node=24
##### Wall time requested by job
#SBATCH --time=15:00
##### Max amount of RAM requested by job per cpu
#SBATCH --mem-per-cpu=4gb
##### Partition name
#SBATCH -p plgrid-testing
##### Name of job in queuing system
#SBATCH --job-name=adf.parallel
##### Name of computational grant used
#SBATCH -A <computational grant name>

echo "Computation started on work node: "; hostname

# Set environment for default ADF version
module add plgrid/apps/adf
 
# Information about temporary scratch directory
echo "Temporary files stored in" $SCM_TMPDIR
 
# Commands to start computations
adf < input.in  >& input.log
 
# Remove the scratch dir
rm -f $SCM_TMPDIR

PBS

#!/bin/env bash
##### Max amount of RAM requested by job 
#PBS -l mem=12gb
##### Amount of nodes=x:cores=y requested by job
#PBS -l nodes=1:ppn=12
##### Wall time requested by job
#PBS -l walltime=15:00
##### Queue name
#PBS -q plgrid-testing
##### Name of job in queuing system
#PBS -N adf.parallel
##### Name of computational grant used
#PBS -A <computational grant name>

echo "Computation started on work node: "; hostname

# Set environment for default ADF version
module add plgrid/apps/adf

# Changing directory to one from which PBS script was stated (where inputs should be stored)
cd $PBS_O_WORKDIR
 
# Information about temporary scratch directory
echo "Temporary files stored in" $SCM_TMPDIR
 
# Commands to start computations
adf < input.in  >& input.log
 
# Remove the scratch dir
rm -f $SCM_TMPDIR

Status monitoringu

Aby zobaczyć wyniki monitorowania aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Moduły domyślne w ścieżkach

Aby zobaczyć listę domyślnych modułów aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Przypadki użycia

Brak przypadków użycia

Ostatnie wiadomości